X射線單晶衍射儀通過X射線與晶體中規(guī)則排列原子的相互作用,結(jié)合精密儀器與數(shù)學(xué)計算,揭示分子三維結(jié)構(gòu),其原理與流程如下:
核心原理:X射線衍射與布拉格方程
當(dāng)單色X射線(如銅靶的CuKα輻射)照射到單晶體上時,晶體中規(guī)則排列的原子間距與X射線波長數(shù)量級相當(dāng),原子散射的X射線發(fā)生干涉,在特定方向(滿足布拉格方程nλ=2dsinθ的方向)產(chǎn)生強衍射。其中,λ為X射線波長,d為晶面間距,θ為入射角,n為衍射級數(shù)。衍射方向與晶體結(jié)構(gòu)直接相關(guān),每種晶體產(chǎn)生獨特的衍射花樣。
關(guān)鍵步驟:從衍射數(shù)據(jù)到三維結(jié)構(gòu)
數(shù)據(jù)采集:
儀器通過高精度測角儀(如四圓衍射儀)控制晶體旋轉(zhuǎn),使不同晶面依次滿足衍射條件。探測器(如光子計數(shù)型CCD)捕獲衍射信號,記錄衍射點的位置和強度,形成包含晶體結(jié)構(gòu)信息的二維衍射圖。
數(shù)學(xué)反演:
衍射點強度與原子在晶胞中的分布相關(guān)。通過傅里葉變換,將衍射數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為晶胞內(nèi)電子密度的三維分布圖。原子位置對應(yīng)電子密度峰值,從而確定原子坐標(biāo)、鍵長、鍵角等參數(shù)。
結(jié)構(gòu)驗證與優(yōu)化:
結(jié)合化學(xué)鍵信息(如鍵長范圍)和對稱性分析,修正初始結(jié)構(gòu)模型,最終確定分子的精確三維構(gòu)型。
技術(shù)優(yōu)勢與應(yīng)用場景
原子級分辨率:可精確測定原子位置,揭示分子立體構(gòu)型、手性及晶體堆積方式。
廣泛適用性:從簡單無機物到復(fù)雜生物大分子(如蛋白質(zhì)-配體復(fù)合物),均可通過該技術(shù)解析結(jié)構(gòu)。
關(guān)鍵應(yīng)用:在藥物開發(fā)中,該技術(shù)可確定藥物晶型、優(yōu)化分子設(shè)計;在材料科學(xué)中,助力設(shè)計具有特定性能的金屬有機框架(MOF)或共價有機框架(COF)材料。